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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
12/11/2015 |
Actualizado : |
28/10/2019 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
BENÍTEZ-GALEANO, M.J.; RUBIO, L.; BERTALMIO, A.; MAESO, D.; RIVAS, F.; COLINA, R. |
Afiliación : |
MARÍA JOSÉ BENÍTEZ-GALEANO, Universidad de la República (UdelaR)/ Centro Universitario Regional Noroeste, Salto (CENUR); LETICIA PAOLA RUBIO CATTANI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANA MARIA BERTALMIO CASARIEGO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; DIEGO CESAR MAESO TOZZI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; CARLOS FERNANDO RIVAS GRELA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RODNEY COLINA, Universidad de la República (UdelaR)/ Centro Universitario Regional Noroeste, Salto (CENUR). |
Título : |
Phylogenetic studies of the three RNA silencing suppressor genes of south american ctv isolates reveal the circulation of a novel genetic lineage. |
Fecha de publicación : |
2015 |
Fuente / Imprenta : |
Viruses, 2015, v.7, no.7, p.4152-4168. OPEN ACCESS. |
ISSN : |
1999-4915 |
DOI : |
10.3390/v7072814 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Received: 26 May 2015 / Accepted: 17 July 2015 / Published: 22 July 2015. |
Contenido : |
ABSTRACT.
Citrus Tristeza Virus (CTV) is the most economically important virus of citrus worldwide. Genetic diversity and population structure of CTV isolates from all citrus growing areas from Uruguay were analyzed by RT-PCR and cloning of the three RNA silencing suppressor genes (p25, p20 and p23). Bayesian phylogenetic analysis revealed the circulation of three known genotypes (VT, T3, T36) in the country, and the presence of a new genetic lineage composed by isolates from around the world, mainly from South America. Nucleotide and amino acid identity values for this new genetic lineage were both higher than 97% for the three analyzed regions. Due to incongruent phylogenetic relationships, recombination analysis was performed using Genetic Algorithms for Recombination Detection (GARD) and SimPlot software. Recombination events between previously described CTV isolates were detected. High intra-sample variation was found, confirming the co-existence of different genotypes into the same plant. This is the first report describing: (1) the genetic diversity of Uruguayan CTV isolates circulating in the country and (2) the circulation of a novel CTV genetic lineage, highly present in the South American region. This information may provide assistance to develop an effective cross-protection program. |
Palabras claves : |
CITRUS TRISTEZA VIRUS; RT-PCR. |
Thesagro : |
CITRUS; CRUZAMIENTO INTERCROMOSOMICO; FILOGENIA; RECOMBINACION; URUGUAY. |
Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/5167/1/Rivas-F.-Maeso-D.-2015.-Viruses.pdf
http://www.mdpi.com/1999-4915/7/7/2814
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Marc : |
LEADER 02270nam a2200289 a 4500 001 1053851 005 2019-10-28 008 2015 bl uuuu u0uu1 u #d 022 $a1999-4915 024 7 $a10.3390/v7072814$2DOI 100 1 $aBENÍTEZ-GALEANO, M.J. 245 $aPhylogenetic studies of the three RNA silencing suppressor genes of south american ctv isolates reveal the circulation of a novel genetic lineage.$h[electronic resource] 260 $aViruses, 2015, v.7, no.7, p.4152-4168. OPEN ACCESS.$c4168 500 $aArticle history: Received: 26 May 2015 / Accepted: 17 July 2015 / Published: 22 July 2015. 520 $aABSTRACT. Citrus Tristeza Virus (CTV) is the most economically important virus of citrus worldwide. Genetic diversity and population structure of CTV isolates from all citrus growing areas from Uruguay were analyzed by RT-PCR and cloning of the three RNA silencing suppressor genes (p25, p20 and p23). Bayesian phylogenetic analysis revealed the circulation of three known genotypes (VT, T3, T36) in the country, and the presence of a new genetic lineage composed by isolates from around the world, mainly from South America. Nucleotide and amino acid identity values for this new genetic lineage were both higher than 97% for the three analyzed regions. Due to incongruent phylogenetic relationships, recombination analysis was performed using Genetic Algorithms for Recombination Detection (GARD) and SimPlot software. Recombination events between previously described CTV isolates were detected. High intra-sample variation was found, confirming the co-existence of different genotypes into the same plant. This is the first report describing: (1) the genetic diversity of Uruguayan CTV isolates circulating in the country and (2) the circulation of a novel CTV genetic lineage, highly present in the South American region. This information may provide assistance to develop an effective cross-protection program. 650 $aCITRUS 650 $aCRUZAMIENTO INTERCROMOSOMICO 650 $aFILOGENIA 650 $aRECOMBINACION 650 $aURUGUAY 653 $aCITRUS TRISTEZA VIRUS 653 $aRT-PCR 700 1 $aRUBIO, L. 700 1 $aBERTALMIO, A. 700 1 $aMAESO, D. 700 1 $aRIVAS, F. 700 1 $aCOLINA, R.
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Estado
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha actual : |
21/02/2014 |
Actualizado : |
22/05/2018 |
Tipo de producción científica : |
Trabajos en Congresos/Conferencias |
Autor : |
DISEGNA, E.; BOIDO, E.; CARRAU, F.; FARIÑA, L.; MEDINA, K.; MÉNDEZ, M.; RODRIGUEZ, P.; DELLACASSA, E. |
Afiliación : |
EDGARDO JOSE DISEGNA LIGUORI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; EDUARDO BOIDO, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Química; FRANCISCO CARRAU, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Química; LAURA FARIÑA, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Química; KARINA MEDINA, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Química; MARTÍN MÉNDEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; PABLO ANDRES RODRIGUEZ BRUNO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; EDUARDO DELLACASSA, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Química. |
Título : |
Efectos de la aplicación del regulador de crecimiento 3,5-Dioxo-4Propionilciclohexancarboxilato de calcio (BAS 125) en la producción de uvas, composición del vino y aroma del cv. Tannat (Primera comunicación). |
Complemento del título : |
Sección I: Metodología y Ecofisiología. |
Fecha de publicación : |
2003 |
Fuente / Imprenta : |
In: Jornadas, 13as. (3-8 Feb. 2003 : Montevideo, UY).; GESCO. Libro de actas / GESCO 2003. Uruguay. Montevideo : Banco de Seguros del Estado, 2003. |
Páginas : |
p. 51-55 |
Idioma : |
Español |
Notas : |
Organizadores de las XIII Jornadas del GESCO: Milka Ferrer (Fac.Agron. UDELAR); Edgardo Disegna (INIA); Graciela Calero y Emilia Pattarino (Escuela de Vitivinicultura); Julio Borsani, Jorge Fernández y Enrique Mirazo (FUCREA); Ana Castillo (PREDEG); Reinaldo De Lucca (JUNAGRA); Alfredo Silva (INAVI); Luis Púa y Dante Villarino (Asociación de Enólogos del Uruguay); Jorge Tonietto (EMBRAPA). |
Palabras claves : |
TAMAÑO DEL GRANO; TANNAT. |
Thesagro : |
COMPUESTOS AROMATICOS; PLANTAS PARA BEBIDAS; POLIFENOLES; SABOR; VID; VINOS; VITIS VINIFERA. |
Asunto categoría : |
-- |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/9704/1/Disegna-E.-Gesco-2003-p.51-55.pdf
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Marc : |
LEADER 01455naa a2200325 a 4500 001 1004681 005 2018-05-22 008 2003 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aDISEGNA, E. 245 $aEfectos de la aplicación del regulador de crecimiento 3,5-Dioxo-4Propionilciclohexancarboxilato de calcio (BAS 125) en la producción de uvas, composición del vino y aroma del cv. Tannat (Primera comunicación). 260 $c2003 300 $ap. 51-55 500 $aOrganizadores de las XIII Jornadas del GESCO: Milka Ferrer (Fac.Agron. UDELAR); Edgardo Disegna (INIA); Graciela Calero y Emilia Pattarino (Escuela de Vitivinicultura); Julio Borsani, Jorge Fernández y Enrique Mirazo (FUCREA); Ana Castillo (PREDEG); Reinaldo De Lucca (JUNAGRA); Alfredo Silva (INAVI); Luis Púa y Dante Villarino (Asociación de Enólogos del Uruguay); Jorge Tonietto (EMBRAPA). 650 $aCOMPUESTOS AROMATICOS 650 $aPLANTAS PARA BEBIDAS 650 $aPOLIFENOLES 650 $aSABOR 650 $aVID 650 $aVINOS 650 $aVITIS VINIFERA 653 $aTAMAÑO DEL GRANO 653 $aTANNAT 700 1 $aBOIDO, E. 700 1 $aCARRAU, F. 700 1 $aFARIÑA, L. 700 1 $aMEDINA, K. 700 1 $aMÉNDEZ, M. 700 1 $aRODRIGUEZ, P. 700 1 $aDELLACASSA, E. 773 $tIn: Jornadas, 13as. (3-8 Feb. 2003 : Montevideo, UY).; GESCO. Libro de actas / GESCO 2003. Uruguay. Montevideo : Banco de Seguros del Estado, 2003.
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